Una ayuda por favor, tengo ciertos temores por no conocer del tema

Hola amigos:
Esta es mi primera consulta a la lista, espero que me puedan orientar...
Tengo 2 Hd, el master con windows 2000 server y el esclavo con windows xp
profesional. Pienso desechar el 2000 porque ya no lo estoy usando ya que por
fin he podido acostumbrarme al xp profesional (aunque la lectura de archivos
mediante su explorador es más lenta que bajo 2000). Lo que deseo hacer es lo
siguiente:

1. Formatear el disco master e instalar Xp profesional
2. Instalar los programas que utilizo y luego de copiar todo del disco
esclavo, formatear este también.

Mis dudas son las siguientes:
Si formateo el master, es lógico que pierda el arranque dual que tengo en
este momento. Una vez leí en el web de microsoft (pero "es tan pequeño" que
le perdí el rastro), de un comando que se ejecuta bajo Xp, creo que en una
ventana DOS, y que "arregla" el arranque dual para así poder acceder
nuevamente al disco esclavo. Es decir, volver a tener un arranque dual pero
con dos Xp. ¿es posible hacer esto?¿cómo lo haría?.
La segunda duda es sobre la opción que tiene Xp de importar/exportar
configuraciones. He visto que el wizard me permite seleccionar el medio de
almacenamiento, que puede ser, por lo que veo, hasta una carpeta en otro HD
y por ende, podría grabarlo en un CD como respaldo. Mi actual Xp tiene
"algunos problemas" ocacionados, es claro, por la inexperiencia, ya que en
el proceso de adaptación, algunas cosas han dejado de funcionar como
deberian. Sin embargo, hay varios programas que me ha costado algo de tiempo
el configurarlos a mi gusto. ¿Que tipo de configuración es la que puedo
exportar y luego importar desde la nueva instalación de Xp?¿Para que sirve
realmente esta opción?.

En un mensaje previo en el news, leí sobre la ventaja de particionar los HD
para lograr disponer de un espacio que creo llaman SWAP para utilizarlo como
archivo de paginación. ¿Que es precisamente un archivo de paginación?.
Hablaron ahí sobre una "partición tonta" también, ¿cuál es su
finalidad?.¿Realmente al particionar los HD como sugirieron se logra una
mejora significativa, apenas perceptible o realmente notoria del sistema
operativo?. Esta fué la organización que sugirieron esa vez:

mira según mis pruebas... ( en mi pc solamente ) te recomiendo...
( Yo.. )
1er HD
c: mm pequeño.. 1.5 giga aquí solo copias el cd1 y cd2 del office ( en mi
caso office 2000) esto en FAT32 ( única particion primaria.. el resto
lógicas )
d: aquí el win98 en fat32 con programas en FAT32
e: datos en fat32
f: aquí el winxP con programas en NTFS
g: datos en ntfs

2do HD
h: para swap.. ( yo tengo 1 solo disco .. pero ya que tu tienes 2... )
i: mas datos en ntfs ( o 2 ,, una en fat y otra en ntfs.. o una en fat32...
según necesidad)

Muchas gracias por sus consejos

Sandra