No puedo eliminar un archivo. AYUDA

Tengo una carpeta en C:\Windows\temp que en teoría debería poder eliminar sin
poblemas. Pues bien, lo intento de todas las maneras y no hay forma que
desaparezca. Incluso he probado a entrar desde el modo a prueba de fallos con
el SIMBOLO DEL SISTEMA al arancar el PC, peo esa carpeta no desaparece (la
muy cabrita). La carpeta en cuestión se llama tmp000014e2 (cada sesión que
inicio cambia el de números despues del tmn.) y contiene un archivo
llamado tmp00000000 (siempre se llama igual. Pues eso, que a ve si alguien me
dice como demonios elimino ese archivo (de no ser que fuera del antivirus y
como siempe está en uso no se puede quitar). Siempre me dice que algún
programa le está utilizando. No me deja cambiar el nombre. Cada vez que
reinicio el equipo, la carpeta cambia de nombre, aunque el archivo del
interior siempre es el mismo.
Creo que el problema tiene que ver con "JS.Trojan.Downloader.IstBar.A". El
caso es que no se encuentra el virus ya en mi PC, pero esa carpeta no hay
quien la elimine.
Escaneo con mil utilidades online (antitroyanos, antiespias, antivirus
online ...) y desde mi Pc y ninguna encuentra nada, el troyano ya no está (o
eso creo), pero la carpeta que está en C:\Windows\temp no ahy quien la quite
(bueno si, arranco en modo seguro y la elimino, peo en cuanto vuelvo a
arranca en el modo normal vuelve a aparecer).
Creo que tocando el registro es posible solucionarlo, pero ni idea de que
clave ya que los limpiadoes (egseeker) no ha encontrado nada.

Por favor, a ver si alguien sabe algo, me veo formateando.