¿será virus?

Hola atodos
Les cuento que mi XP andaba bastante extraño pese a mantenerlo actualizado,
con firewall y buen antivirus, sin embargo repentinamente comenzó a negarme
la entrada y otras pesadeses. Como no tenía tiempo de averiguar las
razones, opté por formatear desde win2k para instalar nuevamente (Estaba en
partición D:) Lo curioso de todo esto es que al mover mi carpeta de
descargas antes del formato, en el camino me desaparecieron todos los .exe,
quedando solamente las carpetas con los txt que uso para identificar los
programas. Los busqué por todos lados, incluso usando herramientas de
Ontrack y otros productos para recuperación, y sin embargo los .exe de esa
carpeta desaparecieron totalmente sin dejar huellas.
La totalidad de mis archivos, salvo lo señalado anteriormente, estan sanos y
salvos, lo que me causa una enorme duda. ¿Será un virus? ¿error de disco?
¿error de usuario (yo)?

Si a alguien se le ocurre alguna posible causa que por favor lo comente,
solo para saberlo, ya que tengo copia de todo en mi casa, pero me mata la
duda.

Saludos
Andrés Farias