Registro Google / Ranking

A ver si alguien me puede orientar un poco:

La idea es realizar una aplicacion ASP.NET la cual dependiendo del dominio
que detecte muestre un contenido u otro, es decir, que la aplicacion seria la
misma para www.dominio1.com que para www.dominio2.com, pero esta se adaptaria
al dominio que se escriba en el Browser.

La pregunta es:

Afectara esto en algo a la hora de registrar estos diferentes dominios en
Google y obviamente y lo que mas me interesa, el tema de PageRank sera igual
que teniendo los dominios en Aplicaciones en el IIS distintas?

Espero sus respuestas y muchas gracias de antemano
Juan Pablo