Problemas por Hackers en FTP

Hola.

El tema es asi, me di cuenta que el FTP de la empresa habia crecido sin
explicacion. Para mi sorpresa al revisar los folders me encontre con que
habia un monton de carpetas con una simbologia poco usual, y descubris que
tenia 15 personas conectadas a mi FTP, algo poco usual.
La cuestiosn es que para el FTP Service y saque la info importante de esa
carpeta.
El tema es que la info "rara" que hay no la puedo eliminar y no quiero
sacar el server de produccion para borrarla.

Alguna idea de como borrar todo eso? ya q no puedo ingresar ni hacerme
"owner".

Manteniendo actualizado mi SO con Windows Update se evitan +/- este tipo
de problemas???????



Saludos a tutti y gracias.