Existe Un Borrado Perfecto. ??

Buenas tardes compañeros .

Me estoy topando con algo medio curioso para mi.
Resulta que tengo muchos DTS y en cada dts tengo asignado como primera
tarea
hacer el borrado de ciertas tablas.
despues de cada Delete pongo el comando GO.

Despues de las tareas de borrado vienen otros procedimientos para volver a
llenar las tablas todo esto mediante un flujo COMPLETION.

Un usuario viene ami hablandome de la inconsistencia del ERP (Origen),
pero
comparando la BD origen y la BD Destino me doy cuenta que mi BD Destino es
la que esta mal , que tiene un campo desactualizado o que no se borro
cuando
debia conservando el viejo valor.

Cual es el mejor procedimiento de borrado el cual me deje las tablas
vacias
al 100%. ???????

Estos procedimientos los aplico al Datawarehouse o BI.

Gracias por su valiosa ayuda.