REINSTALAR W98 EN SISTEMA ARRANQUE DUAL W98-WXP, PROBLEMA.

Hola, en mi pc tengo dos particiones, en C tengo w98 y en D wxp, arranque
dual.

Ahora por algunos problemas que tengo en el w98 quería ver si la
reinstalación, que se que no es seguro que pueda dar la solución pero al
menos no me hace perder datos, me los solucionaba, y al querer hacerlo tengo
el siguiente
problema:

Si lo hago con disco de inicio de w98, después de salir las primeras
pantallas de instalación en un punto casi al comienzo, me dice:
Mensaje SU-0013, "El programa de instalación no puede crear archivos en la
unidad de inicio y no puede instalar windows 98. Si usa HPFS o el sistema de
archivos de Windows NT, tendrá que crear una partición de inicio de MS DOS".
En vista de esto solo tengo la opción de "Salir de la instalación"

Si arranco desde el propio CD de instalación de W98, una vez que ha hecho la
comprobación de las unidades de disco, me sale un pantalla que me dice:
"Su pc ya tiene instalado un sistema operativo. Esta versión del programa de
instalación está diseñada para PCs que no tienen sistema operativo. Se
recomienda que salga del programa, reinicie su PC desde el disco duro, si
continua con la instalación los archivos config.sys y autoexec.bat, serán
reemplazados por versiones básicas de estos archivos".

Me da dos opciones:
1) "Salir del programa de instalación (recomendado)"
2) "Continuar la instalación, sustituir el sistema operativo existente"

Si opto por la opción 2, ¿ me sustituiría los dos archivos: config.sys y
autoexec.bat, no respetándome los existentes que contienen la configuración
de los programas instalados ?. Caso de ser así ¿podría ser una solución
valida el copiar los existentes en el W98 desde el WXP y luego una vez
instalado el W98, sustituirlos por los anteriores?.

Agradeceré vuestra ayuda.

Miguel