Recuperar archivos y carpetas

Hola,
Primero tuve el problema que se detalla en la página
“Cómo recuperar un Registro dañado que impide que Windows XP se inicie”:
http://support.microsoft.com/kb/307545/
Creo que lo solucioné con las instrucciones que ahí aparecen.
Luego volví a arrancar Windows XP Prof normalemente pero resulta que hay
archivos y carpetas que SE HAN TRANSFORMADO EN ARCHIVOS SIN EXTENSIÓN DE 32
KB. Por ejemplo una carpeta que tenía llamada "Música" es ahora uno de esos
archivos. Lo mismo con otros archivos y carpetas, ya sean antiguos o
recientes.
A) Cómo puedo recuperar los archivos y carpetas?
B) A que se ha debido el problema de los archivos y carpetas? Puede haber
sido causado por un chkdsk /r que hice desde la Consola de Recuperación?
C) Existe alguna aplicación para analizar el disco duro y el hardaware en
general?
D) Cómo puedo evitar que ambos problemas me vuelvan a suceder?