Problema en el arranque en Win2000 y WinXP

Saludos al Foro, soy novato en estos lares, y os escribo porque me ha surgido
el siguiente problema, de forma súbita y en menos de 48 horas, en dos equipos
independientes, aunque conectados a la misma red local (uno con Windows 2000
y otro con Windows XP):

Los equipos al arrancar muestran el siguiente mensaje desde la consola antes
de mostrar la pantalla de Windows:

WINDOWS NO PUEDE ARRANCAR POR QUE EL SIGUIENTE ARCHIVO FALTA O ESTÁ DAÑADO:
\WINDOWS\SYSTEM32\CONFIG\SYSTEM

PARA REPARAR EL ARCHIVO, INICIE WINDOWS DESDE EL DISCO O CD DE INSTALACIÓN Y
PULSE LA OPCION "R" EN LA PRIMERA PANTALLA.

Después de mostrar el mensaje, cualquier pulsación de tecla reinicia el
sistema, y si si se arranca con el disco de instalación, y se pulsa la tecla
"R" (tal y como nos indica el mensaje), se entra en una consola de
recuperación, pero no se como usarla para reparar el archivo.

Can you help me, Please ?

P.D. El hecho de que el incidente se haya producido casi simultáneamente en
los dos equipos, ¿ Puede indicar que se trata de un virus?


Juan Antonio Mesones López
Unidad de Carreteras de Ciudad Real
Ministerio de Fomento