Problema con comando chkdsk.

Luego de hacer el comando chksdk /r y reiniciar mi pc.Me aparecia un texto que habla sobre la comprobacion de disco,y pasados 3 segundos sin que yo tocara nada me salta abajo "La comprobacion ah sido cancelada"
Y lapregunta es,es gracias a el comando,o es gracias a otro fallo en mi pc,en todo caso como hago para que no se cancele la comprobacion,quiero que se compruebe!