Pregunta sobre sistema de archivos distribuidos

Con Windows 2000 server he configurado varias veces un sistema de
archivos distribuido y nunca he tenido problemas. Una vez asignados los
permisos a las carpetas, el acceso a las mismas se hace correctamente.
El caso es que estoy intentando hacer lo mismo con Windows Server 2003 y
hay un pequeño detalle que me tiene loco.
Creo la Raiz y los vínculos a las diferentes carpetas distribuidas por
la red. Asigno los permisos y puedo entrar en las carpetas perfectamente
en funciona de esos permisos, pero si intento entrar, por la red, en la
carpeta de propio equipo, no me permite el acceso. Y esto me pasa con
todos los equipos con sus propias carpetas, pero no con las de los
demás. En Windows 2000 server esto no me pasa.
¿Alguien sabe por qué ocurre esto?

Un saludo y gracias