particion activa

Hola compañeros, tengo la siguiente duda, a ver si alguien me la puede
resolver:

Instalando un winxp pro en un equipo, todo perfecto, sin problemas, una vez
instalado, le pincho un disco duro que antes tenía otro winxp pro. y
entonces, el equipo no me arranca. solo arranca (sorprendentemente) con el
cd de windows xp en el lector de cd.

Una vez arrancado, me doy cuenta de que la partición activa, es la del disco
duro que he recienpinchado, y que está de esclavo del otro disco duro (del
que hice la instalación limpia)

Como puedo hacer para que la partición activa sea la del disco duro donde
instalé el sistema?

Alguien tiene alguna explicación para esto? Gracias.