Interferencias entre nombre DOMINIO y SITIO en Internet

Hola,

estoy intalando un Windows 2003 Server Estándar. Imaginaros que al dominio
le pongo de nombre "pepe", por lo que en el DHCP y demás servicios aparecerá
"pepe.com" como nombre habitual. Incluso los usuarios pueden iniciar sesión
com usuarioadm@pepe.com, usuario1@pepe.com, etc.

Bien, hasta aquí todo OK. Pero... resulta que tengo un sitio en internet en
un proveedor, registrado bajo el dominio www.pepe.com , con un servidor POP3
de correo en el proveedor con cuentas como usuario1@pepe.com, etc.

¿No entrarán en conflicto estos dos dominios (el local y el de internet) en
algún momento con algún asunto y me complicarán la vida?

Saludos.