ayuda urgente

hola desde hace unos dias me sale el siguiente mensaje:
THE BOOT DEVICES HAVE BEEN CHANGED. BBS BOOT PRIORITY WILL BE AFFECTED.
PLEASE ENTER SETUP TO CHECK.
he entrado en modo seguro y he pasado el antivirus que tengo actalizado,
tambien he pasado mi ad-aware que tambien tengo actualizado, he hecho un
scandisck, he desfragmentado y todo esta bien. pero cuando quiero cerrar el
pc, o reiniciar tarda mucho tiempo en hacerlo, tampoco puedo restaurar el
sistema cuando lo hago me dice restauracion incompleta. tengo que decir que
tengo un disco duro extraible que apague de un interruptor que lleva ,antes
en propiedades de ese disco en propiedades, en la pestaña de reproduccion
automatica cambie donde pone archivos de musica por contenido mixto, tambien
cambie seleccionar la accion que desea ejecutar por preguntarme siempre que
elija una accion.tiene esto algo que ver y de ser asi como lo puedo
arreglar. muchas gracias