¿Soporta un sistema en modo nativo, NTLM?

Tenemos un sistema que queremos migrar a modo nativo, cuando lo migremos
se
instalará un portal web OpenCMS, que entre una de sus peculiaridades está
la
de poder autenticar usuarios de windows (mediante unas librerias de
Java...)
utilizando NTLM.
Mi pregunta es si cuando esté funcionando el sistema en modo nativo, está
autenticación seguirá funcionando.

Muchas gracias, de antemano.

Sergio Sánchez.