Base Intranet

Hola a todos, me encuentro desarrollando la intranet de la
empresa que trabajo, como ustedes saben siempres en una
intranet existen aplicaciones propias de cada
departamento, ahora bien la pregunta es hacer que cada
aplicacion departamental tenga su propia base o hacer una
sola base que contemple la intranet y a su vez el resto de
aplicaciones?

Gracias