Problema con Server que es (Domain controler / DNS / File Server)

Buenas tardes, tengo un problema con un equipo que tiene instalado Windows
2003 server, el cual trabaja como domain controler, por ello cuenta con los
roles de Directorio Activo, DNS y a esto se suma que es FILE SERVER.

El inconveniente es que de la nada se bloquea y no permite que los usuarios
que estan trabajando sobre sus archivos, puedan guardar, abrir, modifcar ni
nada, pues corta todo acceso, no funciona entrar por escritorio remoto,
tampoco VNC ni siquiera responde por el ILO que tiene configurado, como veran
al tener los roles antes mencionados, los usuarios pierden su data, acceso al
internet y se les cuelgan las PC's tambien.
Incluso para descartar un problema de hardware, hemos migrado a un nuevo
hardware y para descartar S/O hemos creado un nuevo nombre de dominio de 0 y
se han agregado maquina por maquina al nuevo dominio.

Pero presenta la misma falla que es aleatoria, pues puede suceder en un dia
dos, tres ó mas veces, como no pasar nada por uno o dos dias.

Mi file server cuenta con al menos 250 GB de información y al menos un un
30% tienen rutas muy extensas, para descartar un problema con el FILE SERVER
incluso estoy empezando a revisar y acortar los nombres "LARGOS" de archivos
y carpetas, esto si es un problema ya que en muchos casos sobrepasan los 500
caracteres a mas las rutas de archivos y carpetas, pero no se si esto
ocasionaria un corte asi de radical a todo los servicios.

Espero alguien pueda orientarme y mencionarme que puedo hacer, agradecere
mucho su apoyo.