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Hola, chamba:
Es mejor que lo hagas al reves: instala y configura sharepoint services 3.0
que es gratuito, y completalo con los desarrollos asp.net que necesites, bien
en forma de paginas aspx o de webpart que se incluyen dentro de las paginas
aspx ya existentes en sharepoint.
De esta forma ya aprovechas toda la infraestrucutra de sharepoint (permisos,
navegacion, menus, etc).
Si lo hicieras al reves tendrias que desarrollarte tu toda la parte aspx, y
ademas montar un sharepoint en paralelo, configurarlo minimamente y acceder a
el mediante webservices, lo que es mucho mas trabajo