misma consulta con sql2000 y sql2005

Buenos días,

Estoy haciendo pruebas con dos servidores de sql para migrar al 2005 y hago
la misma consulta en los dos servidores y en el servidor de sql2005 la
consulta me la devuelve en 18 segundos, en el servidor del sql2000 tarda
1minuto y 30 segundos, teniendo en cuenta que en las dos bases de datos hay
la misma información y que el servidor del sql2000 es mas potente .¿Es
posible que todo sea por el cambio de versión?

Os pongo las caracteristicas de los dos servidores

Primer servidor sql 2000, con windows 2003 standrd edition,3 gb de ram y cpu
a 3.20 Ghz con 4 procesadores

Segundo servidor con sql2005, con windows 2003 standrd edition,1 gb de ram y
cpu a 3.00 Ghz con 2 procesadores.

Muchas gracias por adelantado.