Listar archivos de disco duro 1024GB

Hice un programa con las funciones de directorio, pero solo me funciona
correctamente en discos duros de 300 GB, cuando ejecuto el mismo programa en
un disco de arreglos que conforman 1024 GB a mas el programa no funciona.
Se podría tener acceso directamente a la tabla de direcciones de archivos
como lo era la FAT32 en su momento para poder obtener el total de los
nombres de archivos en forma rápida y sin impactar en la performance del
servidor.

Saludos y Gracias

José Luis Cocha
Especialista TI
Lima Perú