Lentitud. -Despues de borrar archivos.-

Como ocurre desde los inicios de los tiempos, al caer la luz uno recurre a
los dioses del olimpo
Tengo un equipo con Win 98, esta en red con Win2000, no tengo problemas de
virus, está instalado el Norton AV Corp. Ed. en el servidor, el cual tiene
un router que a la vez hace de firewall(?). Tengo por otro lado instalado
Ad-Whare -en el equipo local y que ultimamente no lo puedo actualizar-,
tambien ejecuto seguido el Spybot Search y Destroy. Un punto en contra es
que tengo en C:\ 620 MB libres, existe otra particion -D:\ con mas espacio
donde pongo todas mis cosas allí. Win está instalado en C:\. Tambien ejecute
hace poco scandisk y defrag (este ultimo a modo prueba de fallo para que no
re_reinicie.)
El problema es el siguiente:
Todos los dias elimino archivos grandes (a veces con la tecla shift para que
no vaya a la papelera) y luego de esa accion la PC se pone lenta y debo
esperar unos cuantos segundos para que funcione y preferiblemente tengo que
reiniciarla para que no aparezca el problema otra vez. Y ultimamente me esta
ocurriendo al cambiar el nombre de un archivo.
Si alguno de ustedes me puede indicar por donde puedo empezar a buscar para
solucionar este problema se los agradeceré.
Muchas Gracias.