DNS, pueden vivir dos resolviendo el mismo dominio como Master

Estimados,
Estoy tratando de reconfigurar una red con AD. Inicialmente pusieron un
servidor Linux como servidor primario DNS, y tambien se activo el DNS
integrado al AD en el DC. En las estaciones de trabajo que dependen del
dominio pusieron como DNS primario el DNS Linux y el de windows como
secundario. El servidor linux tambien es usado como proxy de las
sucursales. El dns de windows tiene configurado como forwarders el de
linux pero aparentemente no se sincronizan ya que en mi pc he dejado solo
el DNS windows como DNS y he tratado de resolver nombres que se que estan
en el DNS linux y no se resuelven. Este problema (sincronizacion)puede ser
debido a que ambos DNS son maestros de mi dominio??
gracias... cualquier ayuda es bien recibida

Daniel valenzuela