Crear instalador de aplicacion y actualzador

Que tal gente,

Tengo una aplicacion desarrollada en visual 2010 el problema que tenemos es al momento de realizar la distribucion de actualziaciones tratamos de crear un proyecto que instalae de nuevo los exe y dll pero este elimia toda informacion del usuario como imagenes que tiene guardadas y la misma configuracion del usuario, provoncando que de nuevo tenga que aplicar los valores de configuracion siendo esto algo molesto debido a la cantidad de parametros que se deben capturar, tambien hemos hecho la distribucion mediante click once pero obtenemos el mismo resultado la configuracion y archivos propios del usuario son eleiminados, tratamos de crear nuestro propio sistema de actualizacion el unico problema que tenemos es con windows 7 que cualquier movimiento que tratamos de realizar nos los bloquea esto al tratar de copiar los respaldos de los archivos del usuario a la carpeta de instalacion y tambien se nos bloquea el mismo exe actualizador por lo que hemos decidido buscar algunas otras soluciones que nos eprmita realizar esta tarea, alguna recomendacion de algun software que permita crear los instaladores y de la misma forma nos permita crear actualizaciones, se los agradezco.