Contenido sysvol desaparece

Buenas,

Me pasa una cosa un poco rara a ver si alguien me echa una mano. Tengo
dos DC con w2000 server ambos como controladores de dominio. Todas las
pruebas de replicación con las herramientas dcdiag, netdiag, replmon,
repadminson perfectas. El visor de sucesos limpio. Lo que me ocurre es
que el contenido de la carpeta sysvol\domain me desaparece en ambos DC. A
veces al reiniciar el principal pero es aleatorio, no sigue un patrón. En
ese momento deja de permitirme entrar a las políticas por usuarios y
equipos.
Miré los puntos de unión de la carpeta sysvol y están perfectos, la volví
a generar y nada, vuelve a desaparecer. No tengo aún ninguna politica
configurada, vuelvo a copiar esas carpetas a mano y todo vuelve a funciona
perfecto. Cuando desaparece porque empiezan a darme errores los servidores
y todos los equipos no veo absolutamente nada en el visor de sucesos. Por
usuarios y equipos opción avanzada, politicas, estan las mismas que en
sysvol\domain\policies. No hay
Lo único raro que detecto es lo siguiente:

- Se me ocurrió hacer una copia a mano a otra carpeta en el DC principal
de sysvol y ahora no hay forma de eliminarla. Además sus puntos de unión
funcionan y lo que cambie en la sysvol original me replica en esta copia.
-Me daba errores al reiniciar de que no podía generar el recurso
compartido netlogon, pero eso ya lo arregle al regenerar sysvol con los
paso que da microsoft y que ya aconsejaron a otros amigos del foro.

Tengo que implantar las políticas de grupo pero estoy fastidiado si me
desaparece el contenido de \sysvol\domain.

Gracias y un saludo