"Compilacion condicional"

Hola,
Tengo una aplicación que usa SQL2005 y que usan distintos clientes
.refiriéndome al cliente como al que paga ;)
Uno de estos clientes, quiere que le haga una modificacion de una regla
que está implementada en un trigger.

Hasta ahora, tengo en mi servidor de desarrollo una sola base de datos,
que es la que distribuyo junto con la aplicación.
Y los cambios para este cliente en concreto los he realizado con
compilación condicional desde visual studio.
Pero, y los de la base de datos? No quiero, a partir de ahora, mantener
dos bases de datos.

Lo que he hecho es poner en un campo de una tabla una "marca"
identificando la versión de la base de datos, y en el trigger realizo una
accion u otra dependiendo de este campo.

Hay alguna otra forma?

Grácias